Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hoxa4P06798 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Hoxa4P06798 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms