Protein–RNA interactions for Protein: P01671

Ig kappa chain V-III region PC 7175, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01671 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01671 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01671 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01671 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01671 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01671 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01671 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01671 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01671 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01671 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01671 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01671 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01671 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01671 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01671 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01671 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01671 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01671 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01671 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01671 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01671 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01671 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01671 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01671 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01671 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01671 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01671 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01671 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01671 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01671 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01671 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01671 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01671 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01671 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01671 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01671 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01671 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01671 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01671 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01671 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01671 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01671 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01671 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P01671 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01671 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01671 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P01671 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01671 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01671 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01671 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01671 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01671 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01671 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01671 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01671 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01671 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01671 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01671 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01671 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01671 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01671 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01671 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01671 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01671 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01671 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01671 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01671 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01671 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01671 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01671 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01671 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01671 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01671 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01671 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01671 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01671 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01671 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01671 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01671 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01671 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01671 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01671 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01671 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01671 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01671 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01671 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01671 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01671 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01671 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01671 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01671 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01671 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01671 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01671 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01671 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01671 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01671 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01671 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01671 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01671 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms