Protein–RNA interactions for Protein: O70583

Mid1, E3 ubiquitin-protein ligase Midline-1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1O70583 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mid1O70583 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Mid1O70583 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mid1O70583 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mid1O70583 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mid1O70583 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mid1O70583 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mid1O70583 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mid1O70583 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mid1O70583 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms