Protein–RNA interactions for Protein: O70507

Hcn4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn4O70507 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hcn4O70507 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms