Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SlkO54988 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SlkO54988 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SlkO54988 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SlkO54988 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SlkO54988 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SlkO54988 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SlkO54988 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SlkO54988 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SlkO54988 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SlkO54988 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SlkO54988 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SlkO54988 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SlkO54988 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SlkO54988 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SlkO54988 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SlkO54988 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SlkO54988 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SlkO54988 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SlkO54988 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SlkO54988 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SlkO54988 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SlkO54988 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SlkO54988 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SlkO54988 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SlkO54988 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SlkO54988 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SlkO54988 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SlkO54988 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SlkO54988 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SlkO54988 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SlkO54988 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SlkO54988 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SlkO54988 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SlkO54988 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SlkO54988 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SlkO54988 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SlkO54988 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SlkO54988 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SlkO54988 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SlkO54988 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SlkO54988 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SlkO54988 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SlkO54988 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SlkO54988 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SlkO54988 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SlkO54988 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SlkO54988 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SlkO54988 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SlkO54988 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SlkO54988 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SlkO54988 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SlkO54988 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SlkO54988 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SlkO54988 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SlkO54988 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SlkO54988 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SlkO54988 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SlkO54988 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SlkO54988 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SlkO54988 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SlkO54988 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SlkO54988 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SlkO54988 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SlkO54988 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SlkO54988 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SlkO54988 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SlkO54988 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SlkO54988 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SlkO54988 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SlkO54988 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SlkO54988 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SlkO54988 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SlkO54988 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SlkO54988 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SlkO54988 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SlkO54988 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SlkO54988 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SlkO54988 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SlkO54988 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SlkO54988 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SlkO54988 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SlkO54988 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SlkO54988 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SlkO54988 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SlkO54988 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SlkO54988 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SlkO54988 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SlkO54988 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SlkO54988 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SlkO54988 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SlkO54988 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SlkO54988 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SlkO54988 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SlkO54988 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SlkO54988 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SlkO54988 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SlkO54988 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SlkO54988 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SlkO54988 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms