Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnd2O35927 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnd2O35927 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnd2O35927 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnd2O35927 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnd2O35927 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnd2O35927 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnd2O35927 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ctnnd2O35927 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnnd2O35927 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnnd2O35927 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnnd2O35927 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnnd2O35927 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnnd2O35927 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnnd2O35927 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnnd2O35927 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnnd2O35927 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnnd2O35927 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnnd2O35927 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnnd2O35927 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnnd2O35927 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnnd2O35927 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnnd2O35927 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnnd2O35927 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnnd2O35927 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnnd2O35927 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnnd2O35927 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ctnnd2O35927 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ctnnd2O35927 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms