Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cited2O35740 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Cited2O35740 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Cited2O35740 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cited2O35740 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cited2O35740 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited2O35740 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited2O35740 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited2O35740 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited2O35740 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Cited2O35740 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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