Protein–RNA interactions for Protein: O35595

Ptch2, Protein patched homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptch2O35595 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptch2O35595 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptch2O35595 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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