Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk4O35493 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk4O35493 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk4O35493 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk4O35493 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Clk4O35493 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk4O35493 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk4O35493 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Clk4O35493 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Clk4O35493 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Clk4O35493 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk4O35493 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk4O35493 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk4O35493 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Clk4O35493 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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