Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

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Length 966 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Pkd2O35245 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pkd2O35245 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms