Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nedd9O35177 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Nedd9O35177 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Nedd9O35177 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nedd9O35177 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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