Protein–RNA interactions for Protein: O19442

H2-M9, Histocompatibility 2, M region locus 9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M9O19442 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M9O19442 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M9O19442 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M9O19442 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
H2-M9O19442 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
H2-M9O19442 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
H2-M9O19442 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2-M9O19442 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms