Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Degs1O09005 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Degs1O09005 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Degs1O09005 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Degs1O09005 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Degs1O09005 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Degs1O09005 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Degs1O09005 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Degs1O09005 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Degs1O09005 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Degs1O09005 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms