Protein–RNA interactions for Protein: F8VPK0

Ttc37, Tetratricopeptide repeat domain 37, mousemouse

Predictions only

Length 1,563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc37F8VPK0 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc37F8VPK0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms