Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf6F6VAN0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms