Protein–RNA interactions for Protein: E9Q658

Pate1, Prostate and testis-expressed 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate1E9Q658 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pate1E9Q658 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pate1E9Q658 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pate1E9Q658 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pate1E9Q658 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pate1E9Q658 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pate1E9Q658 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pate1E9Q658 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pate1E9Q658 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pate1E9Q658 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pate1E9Q658 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pate1E9Q658 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Pate1E9Q658 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms