Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trip11E9Q512 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms