Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4S1

Pde8b, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, mousemouse

Predictions only

Length 865 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde8bE9Q4S1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde8bE9Q4S1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde8bE9Q4S1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde8bE9Q4S1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde8bE9Q4S1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde8bE9Q4S1 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde8bE9Q4S1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde8bE9Q4S1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde8bE9Q4S1 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde8bE9Q4S1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde8bE9Q4S1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde8bE9Q4S1 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde8bE9Q4S1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde8bE9Q4S1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde8bE9Q4S1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde8bE9Q4S1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pde8bE9Q4S1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde8bE9Q4S1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde8bE9Q4S1 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde8bE9Q4S1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde8bE9Q4S1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde8bE9Q4S1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde8bE9Q4S1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde8bE9Q4S1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde8bE9Q4S1 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde8bE9Q4S1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde8bE9Q4S1 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde8bE9Q4S1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde8bE9Q4S1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde8bE9Q4S1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde8bE9Q4S1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde8bE9Q4S1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde8bE9Q4S1 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde8bE9Q4S1 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde8bE9Q4S1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde8bE9Q4S1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde8bE9Q4S1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde8bE9Q4S1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde8bE9Q4S1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pde8bE9Q4S1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pde8bE9Q4S1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms