Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms