Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cttnbp2B9EJA2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cttnbp2B9EJA2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms