Protein–RNA interactions for Protein: B1AZQ8

Cldn34b1, Claudin 34B1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b1B1AZQ8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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Cldn34b1B1AZQ8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Cldn34b1B1AZQ8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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Cldn34b1B1AZQ8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b1B1AZQ8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b1B1AZQ8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b1B1AZQ8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Cldn34b1B1AZQ8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Cldn34b1B1AZQ8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Cldn34b1B1AZQ8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Cldn34b1B1AZQ8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b1B1AZQ8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cldn34b1B1AZQ8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Cldn34b1B1AZQ8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Cldn34b1B1AZQ8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Cldn34b1B1AZQ8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Cldn34b1B1AZQ8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Cldn34b1B1AZQ8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cldn34b1B1AZQ8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34b1B1AZQ8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34b1B1AZQ8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34b1B1AZQ8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34b1B1AZQ8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34b1B1AZQ8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34b1B1AZQ8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34b1B1AZQ8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34b1B1AZQ8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34b1B1AZQ8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn34b1B1AZQ8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Cldn34b1B1AZQ8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms