Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Itga8A2ARA8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms