Protein–RNA interactions for Protein: A2AIW0

Sdccag3, Serologically defined colon cancer antigen 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag3A2AIW0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sdccag3A2AIW0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdccag3A2AIW0 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdccag3A2AIW0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdccag3A2AIW0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdccag3A2AIW0 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sdccag3A2AIW0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms