Protein–RNA interactions for Protein: A2A9G7

Shisal2a, Protein shisa-like-2A, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2aA2A9G7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Shisal2aA2A9G7 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms