Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms