Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Mbd3Q9Z2D8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mbd3Q9Z2D8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms