Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z204

Hnrnpc, Heterogeneous nuclear ribonucleoproteins C1/C2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpcQ9Z204 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HnrnpcQ9Z204 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms