Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Hmg20bQ9Z104 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmg20bQ9Z104 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmg20bQ9Z104 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmg20bQ9Z104 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmg20bQ9Z104 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Hmg20bQ9Z104 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Hmg20bQ9Z104 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmg20bQ9Z104 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmg20bQ9Z104 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmg20bQ9Z104 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmg20bQ9Z104 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Hmg20bQ9Z104 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Hmg20bQ9Z104 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Hmg20bQ9Z104 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmg20bQ9Z104 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmg20bQ9Z104 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Hmg20bQ9Z104 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Hmg20bQ9Z104 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Hmg20bQ9Z104 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Hmg20bQ9Z104 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Hmg20bQ9Z104 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hmg20bQ9Z104 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Hmg20bQ9Z104 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Hmg20bQ9Z104 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hmg20bQ9Z104 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms