Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gpc6Q9R087 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gpc6Q9R087 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms