Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sh2d3cQ9QZS8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms