Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rnf4Q9QZS2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Rnf4Q9QZS2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Rnf4Q9QZS2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Rnf4Q9QZS2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rnf4Q9QZS2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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