Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK7

Rnf11, RING finger protein 11, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf11Q9QYK7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Rnf11Q9QYK7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Rnf11Q9QYK7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf11Q9QYK7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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