Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM7

Msh5, MutS protein homolog 5, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh5Q9QUM7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Msh5Q9QUM7 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Msh5Q9QUM7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 4930555F03Rik-201ENSMUST00000033963 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Msh5Q9QUM7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Msh5Q9QUM7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Msh5Q9QUM7 Gm44840-201ENSMUST00000208983 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Msh5Q9QUM7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Msh5Q9QUM7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Msh5Q9QUM7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Msh5Q9QUM7 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms