Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK7

Tmod2, Tropomodulin-2, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod2Q9JKK7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Tmod2Q9JKK7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmod2Q9JKK7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
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Tmod2Q9JKK7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmod2Q9JKK7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Tmod2Q9JKK7 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Tmod2Q9JKK7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Tmod2Q9JKK7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Tmod2Q9JKK7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tmod2Q9JKK7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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Tmod2Q9JKK7 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Tmod2Q9JKK7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Tmod2Q9JKK7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
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Tmod2Q9JKK7 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod2Q9JKK7 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod2Q9JKK7 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod2Q9JKK7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod2Q9JKK7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod2Q9JKK7 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod2Q9JKK7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod2Q9JKK7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod2Q9JKK7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmod2Q9JKK7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms