Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Mrpl39Q9JKF7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms