Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS0

Scube2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube2Q9JJS0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Scube2Q9JJS0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Scube2Q9JJS0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Scube2Q9JJS0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Scube2Q9JJS0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Scube2Q9JJS0 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Scube2Q9JJS0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Scube2Q9JJS0 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Scube2Q9JJS0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Scube2Q9JJS0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Scube2Q9JJS0 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scube2Q9JJS0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms