Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpf2Q9JJ80 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms