Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tcirg1Q9JHF5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tcirg1Q9JHF5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms