Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Capn12Q9ER56 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Capn12Q9ER56 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms