Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPM5

Sync, Syncoilin, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncQ9EPM5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SyncQ9EPM5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SyncQ9EPM5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms