Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL9

Acox3, Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 3, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acox3Q9EPL9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Acox3Q9EPL9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms