Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tmco5aQ9D9D5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms