Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Derl3Q9D8K3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Derl3Q9D8K3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Derl3Q9D8K3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Derl3Q9D8K3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Derl3Q9D8K3 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Derl3Q9D8K3 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Derl3Q9D8K3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Derl3Q9D8K3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Derl3Q9D8K3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Derl3Q9D8K3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Derl3Q9D8K3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Derl3Q9D8K3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Derl3Q9D8K3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Derl3Q9D8K3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Derl3Q9D8K3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Derl3Q9D8K3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Derl3Q9D8K3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Derl3Q9D8K3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Derl3Q9D8K3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Derl3Q9D8K3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Derl3Q9D8K3 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Derl3Q9D8K3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Derl3Q9D8K3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Derl3Q9D8K3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Derl3Q9D8K3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Derl3Q9D8K3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Derl3Q9D8K3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Derl3Q9D8K3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Derl3Q9D8K3 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Derl3Q9D8K3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Derl3Q9D8K3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Derl3Q9D8K3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Derl3Q9D8K3 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Derl3Q9D8K3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms