Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
4933428M09RikQ9D3X3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms