Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Exosc7Q9D0M0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Exosc7Q9D0M0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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