Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Hdhd3Q9CYW4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Hdhd3Q9CYW4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Hdhd3Q9CYW4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hdhd3Q9CYW4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hdhd3Q9CYW4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hdhd3Q9CYW4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hdhd3Q9CYW4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hdhd3Q9CYW4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hdhd3Q9CYW4 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hdhd3Q9CYW4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hdhd3Q9CYW4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hdhd3Q9CYW4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hdhd3Q9CYW4 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hdhd3Q9CYW4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hdhd3Q9CYW4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hdhd3Q9CYW4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hdhd3Q9CYW4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hdhd3Q9CYW4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hdhd3Q9CYW4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hdhd3Q9CYW4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hdhd3Q9CYW4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Hdhd3Q9CYW4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hdhd3Q9CYW4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hdhd3Q9CYW4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hdhd3Q9CYW4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hdhd3Q9CYW4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms