Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Xrcc3Q9CXE6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms