Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX9

Ddx47, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddx47Q9CWX9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ddx47Q9CWX9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx47Q9CWX9 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx47Q9CWX9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx47Q9CWX9 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx47Q9CWX9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx47Q9CWX9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx47Q9CWX9 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ddx47Q9CWX9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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