Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Nicn1Q9CQM0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Nicn1Q9CQM0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms