Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Pkp2Q9CQ73 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Pkp2Q9CQ73 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms